Ключевая документация
|
В следующих источниках представлена дополнительная информация по темам, рассматриваемым в этом курсе. Все ссылки открываются в новом окне/вкладке. |
Darwin Core
-
https://rs.gbif.org/extensions.html [Расширения Darwin Core, зарегистрированные в GBIF^]
Публикация данных
-
https://doi.org/10.35035/doc-5xdm-8762 [Передовой опыт публикации данных о биоразнообразии, полученных в ходе оценки воздействия на окружающую среду^]
Секретариат GBIF и IAIA: Международная ассоциация по оценке воздействия (2020). -
https://doi.org/10.35035/doc-b8hq-me03 [Руководство для частных компаний по публикации данных через GBIF: Типовой документ для содействия процессу внутреннего утверждения в целях получения статуса издателя GBIF^]
Rui Figueira, Pedro Beja, Cristina Villaverde, Miguel Vega, Katia Cezón, Tainan Messina, Anne-Sophie Archambeau, Rukaya Johaadien, Dag Endresen & Dairo Escobar (2020). -
https://doi.org/10.35035/doc-vf1a-nr22 [Публикация данных, полученных с помощью ДНК, через платформы данных по биоразнообразию^]
Anders F. Andersson, Andrew Bissett, Anders G. Finstad, Frode Fossøy, Marie Grosjean, Michael Hope, Thomas S. Jeppesen, Urmas Kõljalg, Daniel Lundin, R. Henrik Nilsson, Maria Prager, Cecilie Svenningsen & Dmitry Schigel (2020). -
https://doi.org/10.35035/doc-0qzp-2x37 [Передовые методы управления и публикации данных с фотоловушек^]
Reyserhove L, Norton B & Desmet P (2023). -
https://doi.org/10.35035/doc-ynvs-eh84 [Руководство по публикации данных биологических исследований и мониторинга в GBIF^]
Ingenloff K, Svenningsen C, Earl C, Shimabukuro PHF, Sica Y, Gan Y-M, Kachian ZR, Brenton P, Hochachka W, Wieczorek J, Stevenson R, Kazem A, Baskauf S, Zermoglio PF, Bloom D, Rodrigues A, Gamboa Martínez J & Schigel D. (2025).
Публикация данных: IPT
-
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0102623 [Интегрированный инструментарий GBIF для публикации: содействие эффективной публикации данных о биоразнообразии в Интернете^]
Robertson et al. (2014)
GBIF
-
https://doi.org/10.15468/doc-z79c-sa53 [Создание эффективного узла-участника GBIF: концепции и общие соображения^]
Секретариат GBIF (2019).
Географическая привязка
-
https://doi.org/10.15468/doc-gg7h-s853 [Лучшие практики геореферирования^]
Arthur D. Chapman & John R. Wieczorek (2020). -
https://doi.org/10.35035/e09p-h128 [Краткое руководство по геореферированию^]
Paula F. Zermoglio, Arthur D. Chapman, John R. Wieczorek, Maria Celeste Luna & David A. Bloom (2020). -
https://doi.org/10.35035/gdwq-3v93 [Руководство по использованию калькулятора геореферирования^]
David A. Bloom, John R. Wieczorek & Paula F. Zermoglio (2020).
OpenRefine
-
Руководство по очистке данных о биоразнообразии с помощью OpenRefine
Paula F. Zermoglio, Camila A. Plata Corredor, John R. Wieczorek, Ricardo Ortiz Gallego & Leonardo Buitrago (2021). -
http://iphylo.blogspot.com/2012/02/using-google-refine-and-taxonomic.html [Использование Google Refine и таксономических баз данных (EOL, NCBI, uBio, WORMS) для очистки неструктурированных данных^]
Запись в блоге iPhylo. Rod Page, 2012. -
http://iphylo.blogspot.com/2013/04/reconciling-author-names-using-open.html [Согласование имен авторов с помощью Open Refine и VIAF^]
Запись в блоге iPhylo. Rod Page, 2013 г. -
Проверка научных названий с помощью API веб-сервиса портала GBIF
Гостевой пост написан ми и Robert Guralnick в 2013 году. -
iDigBio: Очистка данных с помощью OpenRefine
iDigBio 2013. -
http://www.canadensys.net/2014/have-we-got-the-names-right [Правильно ли мы используем эти названия?^]
Canadensys 2014. -
http://slides.com/dimitribrosens/o-3#/ [Очистка данных с помощью OpenRefine^]
Desmet и Brosens 2016 TDWG. -
EasyOpen Redlist
Запрос данных из Красного списка МСОП с использованием списка видов, OpenRefine и готового кода. Olly Griffin, июль 2019 г. -
https://github.com/SIB-Colombia/data-quality-open-refine/tree/master [Набор скриптов в Open Refine для обеспечения качества данных^] Разработано SiB Colombia.
Качество
-
https://www.gbif.org/document/80509/principles-of-data-quality [Принципы качества данных^]
Arthur Chapman, 2005 г. -
https://www.gbif.org/document/80528/principles-and-methods-of-data-cleaning-primary-species-and-species-occurrence-data [Принципы и методы очистки данных: первичные данные о видах и данных о встречаемости видов^]
Arthur Chapman, 2005. -
https://coffeehouse.dataone.org/2014/04/09/abandon-all-hope-ye-who-enter-dates-in-excel [Будьте осторожны с датами в Excel^]
DataOne 2014. -
Руководство MVZ по регистрации местоположений в полевых записях
Чувствительные виды
-
https://doi.org/10.15468/doc-5jp4-5g10 [Современные передовые методы обобщения данных о встречаемости уязвимых видов^]
Arthur Chapman, 2020 г.
Таксономия
-
https://data-blog.gbif.org/post/gbif-checklist-datasets-and-data-gaps/ [Наборы данных таксономических списков и пробелы в данных GBIF ^]
-
https://www.gbif.org/tools/name-parser [GBIF Labs - анализатор названий^]
-
https://www.gbif.org/tools/species-lookup [GBIF Labs - Сопоставление видов ^]
-
https://biodiversidad.co/formacion/laboratorios/SpeciesMatching [Таксономическая валидация — сопоставление видов^]
-
-
http://resolver.globalnames.org/ [Глобальный сопоставитель названий^]
-
https://obis.org/manual/namematching/ [Стратегия сопоставления морских названий для таксономического контроля качества^]